La petite ville de Mapleton cherche encore à expliquer la subite disparition de centaines des siens, 3 ans auparavant. Ce 14 octobre fatidique, 140 millions de personnes ont disparu subitement de la surface de la Terre, sans laisser de trace. Les habitants de la ville réagissent chacun à leur manière à cet événement inexplicable.
Du jour au lendemain, un 14 octobre en apparence ordinaire, 2% de la population disparaît mystérieusement de la surface de la terre. Ces gens, de tout âge, se sont évanouis dans la nature, sans explication, laissant leurs proches dans l'angoisse, voire le désespoir.
Trois ans plus tard, la vie a repris son cours dans la bourgarde de Mapleton, une petite ville près de New York, mais rien n'est plus comme avant. Personne n'a oublié ce qui s'est passé, ni ceux qui ont disparu. A l'approche des cérémonies de commémoration, le chef de la police locale, Kevin Garvey, est en état d'alerte maximale : des affrontements dangereux se préparent entre la population et un groupuscule comparable à une secte...
Dans le foulée d'une série de rencontres inquiétantes, Kevin rend visite à un thérapeute. Tom se retrouve dans une situation précaire avec Christine, la favorite de Wayne. Une Meg frustrée est solicitée de laisser une partie de son passé derrière elle. Jill et Aimee pistent Nora Durst, célébrité locale ayant perdu toute sa famille lors de la disparition.
Face à la baisse de fréquentation de son église et des menaces de mort, le révérend Matt Jamison continue à prêcher son évangile : que beaucoup de ceux qui ont disparu étaient des pêcheurs et non des saints.
La campagne de Matt prend un autre tournant quand il apprend qu'il peut perdre l'église, le forçant à se lancer dans un plan de dernière minute, désespéré de trouver l'argent nécessaire pour la garder.
Quelqu’un a volé le bébé de la crèche de la nativité. Une fête de Noël se prépare à Mapletown et Kévin doit s’assurer que les membres de la secte ne vont pas venir perturber la soirée. Tommy continue de protéger Christine qui découvre qu’elle est enceinte.
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