Deux agents du FBI sont chargés d'enquêter sur les dossiers non résolus, appelés "X-files" la plupart du temps des affaires où le paranormal entre en jeu. L'agent Fox Mulder, malgré le scepticisme de sa co-équipière Dana Scully, tente de prouver sa thèse du complot gouvernement/extra-terrestres... Fox Mulder n'aura de cesse de rechercher sa soeur disparue des années auparavant lorsqu'il avait 12 ans.
Dana Scully et son collègue du FBI, Jack Willis, ont été informés qu'un couple de braqueurs, Lula et Dupré, allaient commettre un nouveau hold-up dans une banque de Washington. Les deux agents se font passer pour des clients et attendent l'arrivée des truands. Mais l'opération tourne mal...