Deux agents du FBI sont chargés d'enquêter sur les dossiers non résolus, appelés "X-files" la plupart du temps des affaires où le paranormal entre en jeu. L'agent Fox Mulder, malgré le scepticisme de sa co-équipière Dana Scully, tente de prouver sa thèse du complot gouvernement/extra-terrestres... Fox Mulder n'aura de cesse de rechercher sa soeur disparue des années auparavant lorsqu'il avait 12 ans.
La curiosité de Mulder est piquée à vif lorsque Scully lui montre l'enregistrement vidéo du révérend Calvin Hartley avec son fils adoptif Samuel, âgé de 18 ans, qui tiennent un service religieux dans leur congrégation. On y voit Samuel poser sa main sur une femme souffrante. Scully explique à Mulder que la malade a été transportée à l'hôpital, où elle est décédée sans que l'on ait pu trouver une cause logique à sa mort...