Deux agents du FBI sont chargés d'enquêter sur les dossiers non résolus, appelés "X-files" la plupart du temps des affaires où le paranormal entre en jeu. L'agent Fox Mulder, malgré le scepticisme de sa co-équipière Dana Scully, tente de prouver sa thèse du complot gouvernement/extra-terrestres... Fox Mulder n'aura de cesse de rechercher sa soeur disparue des années auparavant lorsqu'il avait 12 ans.
Michelle, infirmière de la maison de retraite Excelsis Dei, a été agressée par une force invisible. Doutant du témoignage de la jeune femme, la police a rapidement classé l'affaire. En désespoir de cause, elle contacte Mulder et Scully. Les deux agents mènent l'enquête dans cet établissement spécialisé dans les troubles du comportement liés à la sénilité...