Deux agents du FBI sont chargés d'enquêter sur les dossiers non résolus, appelés "X-files" la plupart du temps des affaires où le paranormal entre en jeu. L'agent Fox Mulder, malgré le scepticisme de sa co-équipière Dana Scully, tente de prouver sa thèse du complot gouvernement/extra-terrestres... Fox Mulder n'aura de cesse de rechercher sa soeur disparue des années auparavant lorsqu'il avait 12 ans.
Mulder et Scully assistent l'inspecteur Cross sur l'affaire d'un tueur qui laisse les corps de ses victimes se décomposer, à tel point que l'identification est rarement possible et les enveloppe d'une sorte de mucus. Beau parleur sur Internet, le tueur trouve ses victimes sur des sites de rencontres. Selon Mulder, qui a déjà vu un cas similaire, l'homme utiliserait la graisse de ces jeunes femmes pour compenser sa propre déficience cellulaire et survivre...