Deux agents du FBI sont chargés d'enquêter sur les dossiers non résolus, appelés "X-files" la plupart du temps des affaires où le paranormal entre en jeu. L'agent Fox Mulder, malgré le scepticisme de sa co-équipière Dana Scully, tente de prouver sa thèse du complot gouvernement/extra-terrestres... Fox Mulder n'aura de cesse de rechercher sa soeur disparue des années auparavant lorsqu'il avait 12 ans.
Sur le point d'accoucher, une jeune femme confie à son infirmière que le père de son enfant est un extraterrestre. L'enfant vient au monde doté de la «queue du diable». C'est le 5ème enfant né, en quelques semaines avec cette difformité : toutes les mères ont subi une insémination artificielle. La nouvelle s'affiche à la Une de plusieurs journaux... Mulder et Scully se rendent aussitôt en Virginie...