Son esprit est un mystère, ses méthodes sont un miracle.
Atteint du syndrome d'Asperger ainsi que de celui du savant, le Dr Shaun Murphy rejoint un prestigieux hôpital. Livré à lui-même, il éprouve des difficultés à socialiser. Mais en mettant son incroyable don au service de ses patients, ce jeune prodige divise le personnel médical. Saura-t-il être à la hauteur de sa mission ?
La cérémonie de mariage tant attendue de Shaun et Lea est interrompue par une violente attaque à l'hôpital et toute l'équipe est mobilisée pour venir en aide aux victimes. En parallèle, le traumatisme de voir des personnes auxquelles il tient être dans des situations critiques affecte Shaun de bien des façons.
Lors de leur première journée en tant que chirurgiens, le Dr Murphy et le Dr Park rencontrent les résidents qu'ils superviseront : les Dr. Danica Powell et Dr. Daniel Perez. En parallèle, Audrey Lim retourne au travail tout en faisant face à sa nouvelle réalité et aux émotions qui entourent les changements.
L'équipe s'occupe d'une conseillère conjugale très célèbre après qu'elle se soit blessée à la cheville après une chute. Elle leur propose des conseils pour leurs relations. Morgan Reznick remarque que leur patiente pourrait souffrir de quelque chose de bien plus grave. Pendant ce temps, Audrey Lim est déterminée à savoir ce qu'il s'est réellement passé au cours de son intervention chirurgicale et commence à mener son enquête.
L'équipe opère une personne qui adore recréer des stratégies militaires et pour sa part, Dr. Daniel Perez se lance dans une course contre la montre avec Jordan Allen pour rechercher un pied coupé.
Shaun Murphy, Asher Wolke et Powell s'occupent d'un jeune patient à Halloween avec une rare maladie génétique qui va les mener hors des sentiers battus. Pendant ce temps, Aaron Glassman et Shaun Murphy doivent surpasser leurs différents pour travailler ensemble et trouver une solution pour la paralysie dont souffre Lim.
Durant une canicule, Shaun Murphy et Danica Powell sont en conflit concernant la chirurgie de leur patient. Cette situation met à rude épreuve la patience de Shaun et sa volonté à faire des compromis. Pendant ce temps, Lea et Aaron Glassman sont obligés de trouver une solution rapide ou un risque de coupure totale d'électricité pourrait mettre en danger les patients.
Quand une femme enceinte de sextuplés arrive à l'hôpital, le Dr. Marcus Andrews doit diviser les médecins en équipes pour assurer la santé et la sécurité de cet accouchement à risque. Pendant ce temps, Shaun et Lea discutent de la possibilité de fonder une famille.
Les docteurs Murphy, Wolke et Glassman reçoivent un patient avec une compresse chirurgicale infectée dans l'abdomen. Le docteur Park doit faire face à son passé lorsqu'elle traite une victime d'une agression sexuelle.
Shaun créé accidentellement une compétition entre les Dr. Danica Powell et Daniel Perez alors qu'il met en place un nouveau système de classement de performance. Durant ce temps, Morgan Reznick et Alex Park ont sûrement franchi un point de non retour.
Shaun et Lea vont bientôt apprendre que leur grossesse surprise peut arriver avec son lot de complications supplémentaires.
En parallèle, Alex Park, Morgan Reznick et Jordan Allen s'occupent d'une adolescente avec le syndrôme de Gardner dont les antécédents chirurgicaux compromettent l’issue de son hospitalisation.
Sur le chemin de leur babymoon, Lea et Shaun reçoivent une rapide leçon de parentalité lorsqu'ils se précipitent pour aider un chien blessé. Pendant ce temps, le Dr Danica Powell effectue secrètement une opération sur une amie qui pourrait compromettre sa carrière.
Shaun invite Aaron à rester avec lui pendant qu'il a des exterminateurs chez lui et Lea se rend compte que les deux hommes ont beaucoup plus en commun qu'elle ne le pensait. Pendant ce temps, le Dr Morgan Reznick se débat avec une grande décision concernant sa carrière et sa vie personnelle.
Shaun et Leia sont en désaccord avec le style parental et l'éducation qu'ils veulent inculquer à leur futur enfant. Le docteur Kim se bat pour sauver les poumons perforés qu'une de ses patientes attend depuis longtemps.
L'arrivée d'un enfant de trois ans dans le service, victime d'une attaque , ne permet pas à Shaun de trouver ce qui a pu la causer, poussant le docteur Park à approfondir ses recherches.
Une femme est hospitalisée pour des symptômes persistants du Covid-19. Mais l'équipe médicale découvre rapidement que la patiente souffre peut-être d'une maladie bien plus difficile à traiter. La relation d'Andrews et Villanueva est un peu malmenée par leur différence hiérarchique à l'hôpital...
Un patient est hospitalisé dans un état critique en raison d'une blessure d'une incroyable gravité. Les docteurs Andrews et Lim sont en désaccord sur la procédure chirurgicale pour le sauver. Pendant ce temps, Glassman donne quelques conseils paternels au docteur Murphy...
Le docteur Andrews présente au reste de l'équipe un patient dont l'attitude laisse le docteur Wolke stupéfait. Porté par une foi que rien ne semble pouvoir faire vaciller, le malade fait preuve d'un optimisme qui semble incompréhensible aux yeux du médecin...
Au cours d'une opération Glassman et Murphy ont un désaccord qui pourrait avoir des conséquences durables sur leur relation. Morgan Reznick, en congé de maternité, n'est pas au mieux de sa forme, mais peut compter sur le soutien d'Alex Park...
Lea et Shaun arrivent à l'hôpital. La jeune femme est aussitôt installée en salle d'accouchement. Au même moment, Perez et Kalu sont victimes d'un grave accident.
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