Son esprit est un mystère, ses méthodes sont un miracle.
Atteint du syndrome d'Asperger ainsi que de celui du savant, le Dr Shaun Murphy rejoint un prestigieux hôpital. Livré à lui-même, il éprouve des difficultés à socialiser. Mais en mettant son incroyable don au service de ses patients, ce jeune prodige divise le personnel médical. Saura-t-il être à la hauteur de sa mission ?
Shaun et Lea s'adaptent peu à peu à leur nouveau rôle de parents. Ils débattent de l'importance d'instaurer une routine pour le petit Steve. Parallèlement, Shaun reprend son travail à l'hôpital. Il prend en charge deux bébés souffrant de problèmes cardiaques...
Shaun a du mal à s'adapter à Charlie, une étudiante nouvellement arrivée dans l'équipe, qui interfère un peu trop dans la relation entre un patient et sa fille. Park doit procéder à une intervention délicate sur un patient atteint d'une tumeur au cerveau. De leur côté, Lea et Morgan trouvent leurs marques en tant que mères...
La collaboration entre Shaun et Charlie est toujours compliquée, la jeune femme soumettant le chirurgien à un flot incessant de questions. De son côté, Morgan se demande qui désigner comme tuteur de son bébé s'il devait lui arriver quelque chose...
Shaun et Lea ont du mal à équilibrer leurs devoirs parentaux avec leur vie personnelle. Pendant ce temps, Park et Morgan essaient de trouver le temps et l'espace pour raviver leur romance au milieu des exigences de la parentalité et du travail, et la mère de Lim fait une visite surprise...
Les opinions d'Asher sur la construction du mariage compliquent son avenir avec Jérôme. Pendant ce temps, Asher a également brièvement revisité son passé religieux pour aider un patient à se convertir au judaïsme pour sa fiancée...
Alors même que l'équipe médicale se remet difficilement d'un drame qui l'a touchée de près, elle doit se mobiliser pour réagir en urgence après un événement tragique qui a fait de nombreux blessés...
Pour sauver un patient dont l'état de santé nécessite une greffe de rein, Shaun et Jordan doivent trouver un donneur en urgence. Malheureusement, la seule personne compatible est un homme souffrant de troubles mentaux. Sa capacité à donner un consentement éclairé à l'intervention est donc compromise...
Shaun, Jared et le jeune patient de Charlie ont besoin que ses parents se mettent d'accord sur une décision médicale importante qui pourrait grandement améliorer sa santé. Mais ceux-ci ne parviennent pas à se mettre d'accord, ce qui incite l'équipe à essayer d'intervenir au nom de leur patient...
Claire Browne revient du Guatemala pour un examen médical personnel. Les résultats indiquent qu'une intervention médicale est nécessaire. Le docteur Glassman, lui, a du mal à gérer Hannah, qu'il essaie d'aider du mieux qu'il peut, prenant le risque de perdre son poste. De son côté, Park recherche le lieu idéal pour un mariage de dernière minute...
Glassman avoue à Shaun que son cancer a récidivé et qu'il est au stade terminal. Claire s'est évanouie dans les bras de Kalu. Alors qu'ils réfléchissent à leur avenir, les médecins se démènent pour sauver leurs collègues...
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