Mobilisés par le deuil, des frères et sœurs désunis aux pouvoirs extraordinaires découvrent des secrets familiaux troublants – et une menace planant sur l'humanité.
La famille essaie de s'habituer à une vie normale et se rassemble pour localiser Viktor qui a été kidnappé. Lila et Cinq s'intéressent à un groupe mystérieux : les Gardiens.
Après avoir récupéré leurs pouvoirs, les Hargreeves se donnent pour mission de retrouver la fille de Sy Grossman. Une ville au charme désuet les accueille avec hostilité.
Les membres de la bande se séparent pour retrouver Jennifer. Par la suite, ils vont voir Reginald et revisitent des souvenirs porteurs d'indices essentiels à leur mission.
Ayant appris la vérité, le clan cherche Jennifer, mais aussi Ben qui a disparu avec elle. Klaus joue les charlatans pour échapper à son sort. Cinq et Lila veulent changer le passé.
Lila et Cinq se perdent en traversant plusieurs lignes temporelles. Viktor et Reginald cherchent à arrêter Ben dont l'union avec Jennifer promet une issue fatale.
Alors que Ben et Jennifer sont en danger, et que la purge est en cours, la famille se rassemble pour sauver le monde… et arrêter le cataclysme sans fin une bonne fois pour toutes.