Amanda est une jeune et brillante ingénieur aéronautique qui vient de créer un nouveau concept avec lequel elle espère faire fortune. Elle devient folle de rage et de désespoir en apprenant que les plans de son projet lui ont été volés par son propre patron. Mais peu de temps après il est retrouvé mort. Amanda devient immédiatement la première suspecte et est très vite accusée du meurtre.
Nous sommes en l'an 2035. Les quelques milliers d'habitants qui restent sur notre planète sont contraints de vivre sous terre. La surface du globe est devenue inhabitable à la suite d'un virus ayant décimé 99% de la population. Les survivants mettent tous leurs espoirs dans un voyage à travers le temps pour découvrir les causes de la catastrophe et la prévenir. C'est James Cole, hanté depuis des années par une image incompréhensible, qui est désigné pour cette mission.