Megan est pom-pom girl et a un petit ami. Seulement voilà, il se pourrait bien qu'elle soit lesbienne. Ses parents décident donc de l'envoyer en école de « réorientation sexuelle » afin qu'elle réapprenne l'hétérosexualité. Là-bas, elle rencontre la belle Graham...
Simon Spier, 17 ans, n'a dit à personne de son entourage qu'il était homosexuel. Comme il est en dernière année de secondaire, il croit pertinemment que c'est préférable de garder le secret jusqu'à son entrée à l'université. Un jour, un jeune homme anonyme révèle sur le blogue de l'école qu'il est gai. Simon, se sentant interpelé par le message, décide de commencer à correspondre avec lui. Tout se déroule à merveille jusqu'à ce qu'un élève découvre les courriels qu'ils s'échangent et menace Simon de révéler au monde son secret. L'adolescent devra se préparer à affronter les jugements et se réconcilier avec son identité.
Abby s'apprête à demander Harper en mariage lors d'un souper familial à Noël, mais elle comprend que la famille de sa copine ne sait pas qu'elles sont lesbiennes.
Dans la cité de Thamesmead, au sud de Londres, trois ados se morfondent. Jamie est rejeté par ses camarades de classe, Steven est battu par son père et par son frère, et Leah s'évade dans un univers musical bien à elle. Sandra, la mère de Jamie se démène, aussi bien sur le plan professionnel qu'affectif, tout en essayant d'être au plus près de son fils. Pour échapper à la violence des siens, Steven trouve de plus en plus souvent refuge chez Sandra, où il partage la chambre de Jamie. De cette promiscuité naît une amitié, puis une ambiguïté. Une aventure nouvelle débute alors pour Jamie et Steven...
Aaron, jeune mormon, débarque de son Idaho natal pour prêcher à Los Angeles avec deux autres compagnons. Il n'a encore aucune idée des épreuves qui l'y attendent. Christian, son voisin, un gay volage pensant davantage à combler ses sens qu'à trouver un sens à sa vie, a lancé un pari auprès de ses collègues : dévergonder un de ces jeunes prédicateurs. Mais peu à peu des sentiments naissent entre les deux jeunes hommes... ce qui ne fait que compliquer la situation.
Elin, jeune fille de quinze ans, s'ennuie et trouve sa vie morne dans une ville suédoise en dépit des dizaines de garçons qui sont amoureux d'elle. Elle se lie d’amitié avec Agnès, plus timide, que l'on dit lesbienne. Elin va peu à peu se sentir attirée par elle.
Ellie, la capitaine de l’école, adore sa camarade de classe rebelle, Abbie. Déterminée à demander son premier amour à l’année 12 formelle, Ellie conçoit un plan pour rendre public l’invitation, mais avant qu’elle puisse aller avec elle, sa tante morte Tara réapparaît de l’au-delà de la tombe. Croyant qu’elle a été ramenée d’entre les morts pour être la marraine de fée d’Ellie, Tara donne des conseils de rencontre non désirés basés sur sa vie de lesbienne dans les années 80.
Olaf Gunnunderson est un étudiant gay et assumé. Avant de rejoindre sa famille pour les vacances de Noël, il dit au revoir à son petit ami Nathan. Ce que Nathan ignore, c'est qu'Olaf n'à jamais fait son coming-out et que ses parents, lassés de le voir seul, ont invité Abby, son ancienne petite amie du lycée, pour les fêtes. Olaf parvient à gérer tant bien que mal la situation, jusqu'à l'arrivée impromptue de Nathan chez ses parents...
Shortbus suit plusieurs personnages new-yorkais dont les aventures tragi-comiques naviguent entre sexualité et sentiments. Tous fréquentent un club underground moderne, Shortbus, où s'expriment toutes les sexualités. Sofia est sexologue et n'a jamais connu l'orgasme. Avec son mari Rob, elle simule le plaisir depuis des années. Sofia croise Severin, une maîtresse dominatrice qui tente de l'aider. Parmi les patients de Sofia, James et Jamie sont un couple gay qui tente d'ouvrir ses relations sexuelles à un troisième partenaire. James propose une relation avec Ceth, mais Jamie reste sur ses gardes. James semble avoir un projet secret. Il est suivi par un mystérieux observateur, Caleb…
Dans un très chic établissement privé, une reine du lycée déchue passe un accord secret avec une nouvelle élève sans histoires pour se venger de leurs ennemis respectifs.
Larry a un jour sauvé Chuck et voilà qu'il lui demande une grande faveur en retour : agir comme s'il était son partenaire domestique afin que ses enfants puissent bénéficier de sa pension. Mais lorsqu'un bureaucrate suspicieux décide de vérifier leur statut, les deux hétéros doivent s'improviser nouveaux mariés.