Un cambriolage et un meurtre dans un musée de New York déclenchent une enquête de l'agent d'Interpol Nathan Nelson. Lorsqu'il trouve un ancien artefact, Nelson le ramène chez lui pour approfondir ses recherches. Un orage, un caméléon de compagnie et l'artefact confèrent à sa fille, Maggie, des pouvoirs mystiques lui permettant de changer d'apparence à volonté, y compris la capacité d'imiter d'autres personnes et animaux.
Phinéas et Ferb s’apprêtent à célébrer le cinquième anniversaire de Perry, leur ornithorynque de compagnie. Cette journée doit donc être inoubliable et les deux ingénieux frères mettent au point une incroyable catapulte pour améliorer le jeu du badminton, ils l’appellent "l’ornithopulte" mais comme à son habitude, Perry disparaît subitement, appelé par le Major Monogram pour une nouvelle mission secrète. Surpris que leur ami ne soit pas là pour jouer avec eux, Phinéas et Ferb continuent malgré tout à s’amuser et se glissent dans leur catapulte qui les envoie directement… au cœur de l’organisation du mal du terrible docteur, la "Doofenschmirtz Maléfique Anonyme".
Au moment où la G-Force, une équipe d'élite formée de cochons d'Inde spécialement entraînés, est sur le point de sauver le monde, le F.B.I. démantèle l'unité secrète. Mais rien ne pourra arrêter cette bande de héros nouvelle génération composée de Darwin, un chef d'équipe loyal; Blaster, un spécialiste des armes à l'attitude du tonnerre; Juarez, une diva des arts martiaux d'une beauté renversante; et Hurley qui les suit partout où ils vont. Munis de gadgets d'espionnage ultramodernes et poursuivis par le F.B.I., les héros s'engagent dans une course contra la montre pour sauver le monde... au risque d'y laisser leur pelage.
Il y a une explosion soudaine au bord géant des installations océaniques du sommet de Tokyo. L'ombre de Tōru AMOURO, qui travaille pour le Bureau de sécurité de l'Agence nationale de police comme Zéro, apparaît sur le site. En outre, le "triple-face" du personnage connu comme Rei FURUYA en tant que détective et apprenti de Kogoro Mouri, et il est également connu comme Bourbon , membre de l'organisation des hommes en noir. Kogorô est arrêté comme suspect pour l'explosion. Conan mène une enquête pour prouver l'innocence de Kogoro, mais AMOURO se met sur son chemin.
Un duo fantaisiste d’agents secrets, composé de l’exigeant mais rebelle Vladimir et d’Hector le geek vaurien, tient le sort du monde entre ses pattes : suite au vol de la radiésite, matériau classé top secret sur une plateforme offshore, le tandem devra sauver la planète d’une menace climatique au cours de son enquête, menée tambour battant !
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